双荧光素酶实验中，如果检测到的荧光素酶活性数值较低，可能有以下几个原因：

    转染效率低：转染是将目标基因导入细胞中的过程，如果转染效率低，则导入的荧光素酶基因的表达量也会较低，从而导致荧光素酶活性数值较低。

    细胞状态问题：实验中使用的细胞可能存在生理或状态上的问题，如细胞密度过高、存活率低、细胞发育不良等，这些因素都会影响到荧光素酶的表达和活性。确保选用健康、适宜的细胞状态非常重要。

    实验处理条件问题：实验处理条件如培养基成分、培养时间等也可能对荧光素酶的表达和活性产生影响。需要确保合适的培养基配方和培养时间等条件，以维持细胞的正常生长和荧光素酶活性的最佳表达。

    提取和检测方法问题：实验中的荧光素酶提取和检测方法也可能影响活性数值。例如，提取方法不当、荧光素酶底物的浓度过高或过低等因素，都可能导致活性数值较低。

    实验设计问题：实验设计的因素如基因组结构、启动子选择、转染剂选择等也会对结果产生影响。确保实验设计合理并优化参数，有助于提高荧光素酶活性。

    在进行双荧光素酶实验时，需要综合考虑上述因素，并对实验条件进行适当的优化和调整，以提高活性数值的稳定性和可重复性。同时，控制实验中的负对照和阳性对照样本，有助于解释数值低的原因并排除实验操作方面的问题。