酵母双杂交（Y2H）是常用的蛋白质相互作用研究方法，其原理基于酵母细胞中的转录活性分子的相互作用。

Y2H实验基于以下三个主要组件：

    靶蛋白（prey protein）：需要研究的蛋白质，它与其他蛋白质进行相互作用。

    激活域（activation domain，AD）：通常以融合蛋白的形式存在，该融合蛋白同时携带靶蛋白和AD。

    DNA结合域（DNA-binding domain，BD）：也以融合蛋白的形式存在，它能够结合到启动子区域上，从而促进报告基因的表达。

实验步骤如下：

    构建AD和BD融合蛋白质：将靶蛋白与AD载体或BD载体进行融合，得到AD-靶蛋白和BD-靶蛋白两种融合蛋白质。

    转化酵母菌：将AD-靶蛋白和BD-靶蛋白构建的质粒分别转化到酵母菌中。

    检测蛋白质相互作用：将AD-靶蛋白和BD-靶蛋白转化后的酵母菌培养在选择性培养基上，其中只有当两种融合蛋白发生相互作用时，相应的启动子区域才能被BD结合域激活，从而触发报告基因的表达。

    鉴定相互作用：选择性培养基筛选出能够产生报告基因表达的克隆，然后通过进一步验证，如重远程PCR、酵母细胞存活测试等，确认蛋白质之间的相互作用。

    Y2H方法的优点包括对于蛋白质与蛋白质之间的直接相互作用的检测、高通量筛选的可行性以及实验操作简单。但也存在一些限制，例如无法模拟细胞内复杂环境下的蛋白质相互作用，以及可能出现假阳性或假阴性结果的问题。因此，在进行Y2H实验时，需要结合其他实验方法和验证手段，综合分析数据，确保结果的可靠性。