增强子和启动子都是影响基因转录的调控元件，但它们在作用时的位置和方式有所不同，具体区别如下：

    位置：启动子位于基因编码区的上游，通常包含一个TATA box等序列，是RNA聚合酶II结合并开始转录的地方。而增强子则位于启动子上游或下游，可以存在于远距离位置，它们不仅能够增加转录的速率，还可以调整转录的时机和位置。

    功能：启动子在细胞中起着非常关键的重要作用，它提供了一组必需的序列，以便RNA聚合酶II能够结合到基因，然后启动转录。增强子则是细胞调节基因表达的重要机制之一，通过与转录因子结合来激活或阻止转录过程，并且可以增强启动子的活性。

    复杂性：启动子相对比较简单，其中会有TATA盒和启动子元件，其大部分功能都只能是确定RNA聚合酶II结合的位置和向右方向移动的能力。而增强子是一个广泛概念，可能有许多序列和元件组成，包括许多转录因子的结合位点和DNA环形化的序列。

    启动子和增强子都是基因转录中重要的调控元件，虽然二者在位置、功能和复杂性方面存在差异，但都对基因转录起到了重要的调节作用。同时，启动子和增强子也经常相互作用，形成复杂的转录调控网络，实现对基因表达的精确调节。