GST pull down和Co-IP（共免疫沉淀）是两种常用的蛋白质相互作用实验技术，它们的区别主要在于使用的抗原和检测方法不同。

    GST pull down是一种基于亲和层析技术的蛋白质相互作用实验方法。该方法利用谷氨酸-S-转移酶（GST）标记的蛋白质与靶蛋白之间的亲和力来分离和鉴定相互作用蛋白质。具体操作时，将GST标记的蛋白质与细胞裂解物或纯化蛋白质混合，经过亲和层析柱洗涤后，利用SDS-PAGE或Western blot等方法检测共沉淀的目标蛋白质。

    Co-IP是一种基于抗体亲和力的蛋白质相互作用实验方法。该方法通过使用特异性抗体将感兴趣的蛋白质与其互作蛋白质共同免疫沉淀，并通过Western blot或质谱等方法检测共沉淀的蛋白质。具体操作时，将特异性抗体与细胞裂解物或纯化蛋白质混合，免疫沉淀后洗涤并检测共沉淀的目标蛋白质。

    因此，GST pull down和Co-IP的区别在于使用的抗原不同。GST pull down通常用于分离和鉴定与GST标记蛋白质相互作用的蛋白质，而Co-IP则用于共免疫沉淀感兴趣的蛋白质及其互作蛋白质。同时，两种方法的检测方法也不同，GST pull down通常使用SDS-PAGE或Western blot方法检测，而Co-IP则更多地采用Western blot或质谱方法进行检测。