微生物代谢农药物质的代谢物质检测方法可以根据具体的农药和微生物来选择。以下是几种常见的方法：

    液相色谱-质谱联用（LC-MS）：这是一种常用的分析方法，可以用于分离和鉴定农药代谢产物。通过将样品经过液相色谱分离，然后使用质谱技术进行检测和结构鉴定。

    气相色谱-质谱联用（GC-MS）：适用于挥发性和热稳定的农药代谢物的检测。样品首先需要通过气相色谱分离，然后使用质谱进行检测和鉴定。

    核磁共振（NMR）：这是一种用于确定分子结构和功能的非常有力的方法。NMR可以用于农药代谢物的结构鉴定，特别是对于复杂的代谢产物。

    酶联免疫吸附测定法（ELISA）：这是一种基于抗体与目标代谢物结合的方法。ELISA可以快速、灵敏地检测农药代谢物，但通常只能检测特定的代谢物。

    荧光和螢光共振能量转移（FRET）：这是一种用于检测农药代谢物的方法，基于能量从一个分子到另一个分子的无辐射能量转移。可以使用荧光探针或标记来实现对代谢物的检测。

    生物传感器：利用微生物、酶或生物分子构建的生物传感器可以特异性地检测和测量农药代谢产物。这些传感器可以通过测量生物体系中的生物化学变化来实现对代谢物的定量检测。

    以上方法是常见的技术，具体的选择会根据所需检测的农药代谢物和所用微生物的特性来确定。在使用这些方法前，请确保选择适当的实验条件，并遵守相关的操作规范和安全措施。同时，建议参考相关文献或咨询相关专业实验室以获取更具体的方法细节。